NUPEA 1: apoia aulas e pesquisas em análises microbiológicas, dispondo de equipamentos como autoclaves, microscópios, contador de colônias, chapa aquecedora, banho maria, estufas, mesas agitadoras, refrigerador além das vidrarias necessárias como: pipetas, placas de Petri, provetas, tubos de ensaio, etc. Também apoia em aulas e pesquisas envolvendo análises de gordura do leite, dispondo de centrífuga para butirômetros de Gerber, bem como pesquisas em análises eletroforéticas dispondo de cubas e fontes de eletroforese e um sistema de transferência.
NUPEA 2: apoia as pesquisas e prestações de serviços nas análises de controle de qualidade de alimentos (análises de umidade, cinzas, proteínas, gorduras, pH, sólidos solúveis, entre outras), contando com os equipamentos estufa de convecção, estufa com circulação de ar, estufa a vácuo, liofilizador, mufla, digestor de amostras para análises de proteínas, destilador de nitrogênio, extrator de lipídeos, balança com infravermelho, balança analítica, balança semi-analítica, centrífuga refrigerada, pHmetro, refratômetro, actodensímetro, chapa aquecedora, banho maria com aquecimento, banho maria com refrigeração, entre outros. Este laboratório também possui equipamentos de apoio à pesquisa e desenvolvimento de novas formulações alimentícias, como fogão a gás, forno elétrico, forno de micro-ondas, seladora, balança de prato, refrigerador duplex, freezer horizontal, processador de alimentos, batedeira, entre outros.
NUPEA 3: apoia as pesquisas e prestações de serviços nas análises microbiológicas de de alimentos e água, dispondo de infraestrutura, como bicos de Bunsen e fluxo laminar (onde são realizadas as análises bacteriológicas de águas e alimentos), duas autoclaves, microscópios, citômetro de fluxo, contador de colônias, chapa aquecedora, centrífuga para tubos, banho maria, estufas, gabinete para leitura cromogênita, refrigerador,
freezer, banho-maria, duas incubadoras para fermentações e duas estufas para incubação de placas e culturas de microrganismos para análises. Também possui um equipamento que realiza teste rápido de composição de amostras de leite para fins de triagem.